从1946年初开始，国民党特务实施了很多暴行：
　　1月26日，即使在政协会议期间，国民党军警和特务就非法闯入黄炎培的住宅进行搜查；
　　2月10日，较场口庆祝政协成功大会被破坏成“较场口血案”；
　　2月22日，特务暴徒捣毁《新华日报》和《民主报》的营业部；
　　3月1日，捣毁西安民盟总支部的机关报《秦风日报?工商日报联合版》，4月13日，逮捕杀害该报法律顾问、民盟盟员王任律师；
　　5月1日，绑架并企图枪杀民盟西北总支部青年部长、《民众导报》主编李敷仁（后被群众抢救、掩护，转移至延安）。
　　民盟和张澜个人对国民党的一系列法西斯暴行分别提出了抗议，要求追究责任，严惩祸首。
　　1946年3月，国民党在重庆召开六届二中全会，通过修改宪草的五项决定，推翻了政协会议所确定的民主宪政原则。
　　3月30日，国民党在重庆召开一手包办的四届二次国民参政会，企图利用这次会议将推翻政协决议的阴谋合法化。中共的参政员拒绝出席这次会议。
　　31日，民盟发表声明，表示民盟在国民大会和参加政府问题上与中共取得一致态度，拒交国大代表名单。
　　4月宪草审议会议上，民盟代表和中共代表一致反对国民党对政协宪草原则的篡改。

　　
　　1946年5月，国民政府迁返南京后，民盟总部也迁往南京。图为民盟总部在蓝家庄15号（左）和高门楼（右）的办公处。

        1946年5月，国民党政府还都南京，中共在国统区的代表机关和民盟总部也由重庆迁到南京。从此政治斗争的中心由西南地区（重庆、昆明等）转移到华东地区（南京、上海）。
　　与政治斗争平行起伏的还有军事斗争。
　　1946年初，国民党破坏《停战协定》，扩大东北内战。在民盟的调解和一再敦促下，国共两党代表经过谈判，于3月27日签定了《东北停战协定》。
　　4月1日，蒋介石在国民参政会上发表演说，公开撕毁协议，并在美国援助下，派遣大批国民党军队，大举进攻东北解放区。民盟领导人多次邀请双方代表会谈，致函蒋介石和毛泽东，向来华调停的美国国务卿马歇尔提出建议，联合各进步团体发表宣言。但国民党对民主党派的呼声不予理睬，6月大举进攻中原解放区，7月进攻苏皖等解放区，发动全面内战，民盟调解东北内战的工作宣告失败。8月25日，民盟领导人沈钧儒等在上海举行记者招待会，谴责国民党破坏政协决议和停战协定发动内战。